新型冠狀病毒:結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,但破壞力不簡(jiǎn)單
2020年的春節(jié),是個(gè)特殊的春節(jié),各大公共場(chǎng)所停止?fàn)I業(yè),就連飯店和超市的顧客也比往常少了許多。而這些,都是由于2019年12月出現(xiàn)的一種病毒——2019新型冠狀病毒(2019-novel coronavirus, 2019-nCoV)。
或許大家現(xiàn)在聽(tīng)到“病毒”,已經(jīng)不覺(jué)得陌生。但其實(shí)直到19世紀(jì)晚期,煙草花葉病毒引發(fā)的農(nóng)業(yè)大災(zāi)難,引起了人們的重視和研究,病毒這一微小的病原體才逐漸進(jìn)入人類的視野。這些肉眼看不見(jiàn)的病毒,卻在每時(shí)每刻都影響著成千上萬(wàn)人的生命。除卻人類健康,它們還在生物演化、環(huán)境變化等等方面影響著我們的生活,也影響著世間萬(wàn)物,若將我們的世界說(shuō)成是病毒包圍的世界,也毫不夸張。
那么病毒究竟是什么,它長(zhǎng)什么樣子?2019新型冠狀病毒所屬的家庭——冠狀病毒的結(jié)構(gòu)又是怎樣的呢?小小的病毒,為何有這么大的“破壞力”?
不妨讓我們一探究竟。
最簡(jiǎn)單的生命形式——病毒
流感病毒、艾滋病病毒、肝炎病毒、狂犬病病毒……病毒所引發(fā)的人體疾病往往難以治愈,因此顯得非常“可怕”。但其實(shí),它們簡(jiǎn)直可以說(shuō)是自然界中最簡(jiǎn)單的生命形式。
病毒的組成成分往往非常簡(jiǎn)單,最基本的構(gòu)成便是遺傳物質(zhì)(DNA與RNA)和蛋白質(zhì),有時(shí)也會(huì)存在糖類與脂質(zhì)成分的修飾。
病毒的遺傳物質(zhì)可以是DNA,也可以是RNA,同時(shí)又區(qū)分為一條鏈與兩條鏈,即分為單鏈DNA、雙鏈DNA、單鏈RNA與雙鏈RNA四種。不過(guò)無(wú)論是什么DNA還是RNA,雙鏈還是單鏈,這些遺傳物質(zhì)在病毒“傳宗接代”的過(guò)程中都起到了決定作用——遺傳物質(zhì)指導(dǎo)了病毒蛋白質(zhì)的合成,而這些蛋白質(zhì)在病毒結(jié)構(gòu)組成、增殖與傳播過(guò)程中都是必不可少的。
病毒的結(jié)構(gòu)往往也很簡(jiǎn)單,遺傳物質(zhì)位于病毒的內(nèi)部,組成病毒的核心(圖1)。而蛋白質(zhì)則圍繞在遺傳物質(zhì)的外側(cè),形成衣殼,又稱為殼體。
如果我們?cè)陔娮语@微鏡下觀察衣殼結(jié)構(gòu),可以看到它是由許多顆粒狀的單元結(jié)構(gòu)整齊排列而成,這一粒粒組成衣殼的小粒子則稱為殼微粒(capsomere)。殼微粒的排列方式不同,使得病毒有了形形色色的形態(tài)。
大多數(shù)病毒的形態(tài)可分為螺旋對(duì)稱(如煙草花葉病毒,圖2)與正二十面體對(duì)稱(如腺病毒,圖2)兩種,除此之外,有些病毒兼具螺旋對(duì)稱與二十面體對(duì)稱的結(jié)構(gòu)(如噬菌體,圖2),這樣的結(jié)構(gòu)被稱為復(fù)合型。
圖1 病毒的結(jié)構(gòu)(圖片來(lái)源:www.khanacademy.org)
圖2 煙草花葉病毒、腺病毒與噬菌體的結(jié)構(gòu)(圖片來(lái)源:《生物學(xué) 八年級(jí)上冊(cè)》人民教育出版社)
但需要注意的是,并不是所有的病毒都可以被劃分為這三類。
而蛋白質(zhì)組成的衣殼,不僅僅起到了保護(hù)病毒遺傳物質(zhì)的作用,也參與了病毒的感染過(guò)程。
除去最基本的遺傳物質(zhì)與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),稍復(fù)雜一些的病毒的外側(cè)還有著由脂質(zhì)和糖蛋白組成的包膜。包膜的主要功能是維護(hù)病毒結(jié)構(gòu)的完整性,并參與病毒入侵宿主細(xì)胞的過(guò)程。首先包膜上的糖蛋白識(shí)別并結(jié)合位于宿主細(xì)胞細(xì)胞膜上的受體,包膜與宿主細(xì)胞的細(xì)胞膜結(jié)合,隨后病毒衣殼與遺傳物質(zhì)進(jìn)入宿主細(xì)胞內(nèi),完成感染過(guò)程。
SARS和新型冠狀病毒都屬于這個(gè)大家族——冠狀病毒
2003年,一場(chǎng)由SARS病毒引起的疫情,使得“冠狀病毒”這個(gè)名詞逐漸走進(jìn)了人們的視野。冠狀病毒因其在顯微鏡下能觀察到明顯的棒狀粒子凸起,形狀好似中世紀(jì)歐洲帝王的皇冠而得名。
1975年,病毒命名委員會(huì)正式命名了冠狀病毒科。根據(jù)病毒的血清學(xué)特點(diǎn)和核苷酸序列的差異,冠狀病毒科又分為冠狀病毒和環(huán)曲病毒兩個(gè)屬。而在2003年引起爆發(fā)性嚴(yán)重急性呼吸綜合征(SARS)的病毒便屬于冠狀病毒科冠狀病毒屬。
冠狀病毒粒子形狀并不規(guī)則,直徑約60-220nm。病毒具有包膜結(jié)構(gòu),上面有三種蛋白:刺突糖蛋白(S,Spike Protein)、小包膜糖蛋白(E,Envelope Protein)和膜糖蛋白(M,Membrane Protein),少數(shù)種類還有血凝素糖蛋白(HE蛋白,Haemaglutinin-esterase)。
S蛋白在識(shí)別并結(jié)合宿主細(xì)胞表面受體,并介導(dǎo)病毒包膜與細(xì)胞膜融合的過(guò)程中起到關(guān)鍵性作用;M蛋白則參與了病毒包膜的形成與出芽過(guò)程;HE蛋白則是構(gòu)成包膜的短凸起,可能與冠狀病毒早期吸附有關(guān),某些冠狀病毒的HE蛋白可引起紅細(xì)胞的凝集以及對(duì)紅細(xì)胞的吸附。
冠狀病毒的核酸為正鏈單鏈RNA,其特點(diǎn)是可以以自身為模板,指導(dǎo)合成病毒相關(guān)蛋白質(zhì)。病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞后,首先以病毒RNA為模板表達(dá)出RNA聚合酶,隨后RNA聚合酶完成負(fù)鏈RNA的轉(zhuǎn)錄合成、各種結(jié)構(gòu)蛋白mRNA的合成,以及病毒基因組RNA的復(fù)制。
圖3 顯微鏡下的SARS冠狀病毒(圖片來(lái)源:www.cdc.gov)
圖4 SARS冠狀病毒結(jié)構(gòu)示意圖(來(lái)源:見(jiàn)圖片左下角)
結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單卻“破壞力”很大的2019新型冠狀病毒
初步了解了病毒的結(jié)構(gòu)與冠狀病毒的結(jié)構(gòu)之后,讓我們把目光放在最近為大家?guī)?lái)很多困擾的新型冠狀病毒上。
不過(guò)想要說(shuō)清楚這次出現(xiàn)的新型冠狀病毒,我們就不能跳過(guò)對(duì)SARS病毒的研究。
在那場(chǎng)突發(fā)的瘟疫災(zāi)難結(jié)束后,科學(xué)家們?nèi)詻](méi)有放棄對(duì)病毒的研究。他們發(fā)現(xiàn),SARS病毒是通過(guò)病毒包膜表面的S蛋白與人體的血管緊張素轉(zhuǎn)化酶Ⅱ(ACEⅡ)相互作用而入侵人體[1]。
而科研人員將新型冠狀病毒的序列與SARS冠狀病毒進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)兩者十分相似。上面我們說(shuō)到,冠狀病毒的S蛋白對(duì)于病毒識(shí)別與入侵有著關(guān)鍵的作用。于是科學(xué)家們對(duì)比了2019-nCoV的S蛋白與SARS冠狀病毒的S蛋白,再通過(guò)計(jì)算機(jī)建立模型,發(fā)現(xiàn)雖然相互作用的五個(gè)氨基酸中有四個(gè)都發(fā)生了突變,但是新型冠狀病毒的S蛋白與人體的ACEⅡ蛋白整體上依舊存在相互作用[2]。
這就說(shuō)明,新型冠狀病毒很有可能是通過(guò)S蛋白與人ACEⅡ相互作用的分子機(jī)制完成感染。
目前對(duì)病毒更深入的研究仍在進(jìn)行中,這些信息可以幫助我們更好地了解病毒,對(duì)指導(dǎo)公共衛(wèi)生安全策略也有著不可忽視的作用。
圖5 計(jì)算機(jī)模型:病毒S蛋白與人ACEⅡ蛋白結(jié)合示意圖(圖片來(lái)源:http://engine.scichina.com/publisher/scp/journal/SCLS/doi/10.1007/s11427-020-1637-5?slug=abstract)
希望這篇文章可以幫助你了解到更多關(guān)于病毒的知識(shí),在面對(duì)疫情的時(shí)候,能夠冷靜理智對(duì)待,不恐慌、不輕視。最后,讓我們向第一線的醫(yī)護(hù)人員和科研人員致敬,提醒家人朋友注意防護(hù),愿疫情早日解除。
參考文獻(xiàn)
1. Wendong, L., et al., Bats are natural reservoirs of SARS-like coronaviruses. 2005.
2. Xintian, X., C. Ping, and H. Pei, Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike for risk of human transmission. 2020.
作者:趙靈羽(中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所)